擬訂全省水生態環境的政策、規劃、制度并組織實施。負責全省地表水生態環境監督管理工作。擬訂全省水功能區劃，開展水生態環境承載力評估。擬訂并監督實施全省重點流域污染防治規劃計劃。組織實施跨界河流斷面水質考核。監督管理全省飲用水水源地生態環境保護工作，指導入河排污口設置。
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